扎克是一名十几岁的男孩，他戴着父亲的一条项链去冲浪，不料被巨浪卷入海中，最后奇迹般被一艘海盗船救起，来到了百慕大三角，海盗船上有一把会说话的神奇宝剑。扎克发现父亲的项链叫做贝鲁之眼的神奇宝石，可以赋予他强大的力量，想要回家，就要变成海盗船船长征服七大洋。为此扎克组建了一支团队：一个鬼男孩，一位亚特兰蒂斯公主，一个维京人还有一个外星人，他将面临的是激烈的海上冒险和意想不到的挑战，从中让自己变得更强大。
袭击了二十世纪的地球的前所未有的大灾害·落星雨。在这场大灾害之下，世界多数的都市遭到毁灭。但，从陨石中发现的未知元素——万应素，让人类的科学技术加速发展，终於诞生出被称作“星脉世代”的、拥有特异之力的新人类。世界最大的综合战斗娱乐项目“星武祭”的舞台，由六所学院包围、通称为六芒星的水上学园都市“六花”。转学到星导馆学园高等部的特待生·天雾绫斗，为了实现自己的愿望，而发誓在这个都市中战斗。
年轻的古生物学家达里厄斯·鲍曼在加利福尼亚州的荒野中发现了活恐龙。
在经过了一系列惊险刺激的大冒险过后，剑客靴猫踏上新的征程。这次他来到一片辽阔壮丽的荒原，当他正纵马驰骋之时，却被一群全副武装的士兵拦了下来。在验证身份之后，剑客靴猫被带进一座华丽庄严的王宫，并见到了亚历山德拉•贝拉冈巴公主。公主愁眉不展，面带忧伤，原来她王冠上的熔火之心红宝石被来自法兰西的盗贼耳语大盗偷走。在追捕耳语大盗的过程中，卫兵们捉到大盗的三个跟班——三只超萌看似天真无邪的幼猫。可是公主与卫兵却称他们为恶魔，公主拜托剑客靴猫从小猫口中问出耳语大盗的巢穴，并召回宝石。剑客靴猫欣然应允，不过他却轻视了眼前这三只诡计多端的小猫……
メジャーリーガーの父（吾郎）を持つ、主人公・茂野大吾と親友の佐藤光、佐倉睦子たちの友情を描いた前作（第１シリーズ）から２年―。 小学６年生だった大吾や睦子は、中学２年生の春を迎えていた。 姉・いずみも通っていた私立風林中の野球部に進んだ大吾たち。 ところが、先輩の多くが抜け、残されたメンバーは個性的な女子ばかり。 そこにクセの強い新入生たちもやってきて…。 山あり谷ありの中学野球部ライフが幕を開ける！？
