在本季《超级飞侠12》中，超级飞侠依然会接收来自世界各地小朋友的电话，为小朋友定制他们需要的特别的东西，并将东西送到他们手上。当小朋友们遇到困难，乐迪会请求总部的帮助，超级飞侠将带来拥有各种属性的愿望能量球，和小朋友们一起摇身一变成为酷炫的愿望守护者，陪同小朋友一起解决问题。而上一季新登场的三位超级飞侠新成员：恐龙飞机超级飞侠大壮、速食卡车超级飞侠糯糯、高速火车超级飞侠咚咚，也会在这一季中展示他们的过人之处。而当困难升级，超级基地也会变成超级机器人，跟超级飞侠一起陪小朋友们度过难关。
福来（Jeff Pace 配音）是一个十三岁的小男孩，某日，调皮的他带着妹妹史黛拉（Michelle Westerson 配音）和堂兄恰克（亚伦·保尔 Aaron Paul 配音）一起溜出去玩。史黛拉在无意之中喝下了邪恶博士马琪尔（特瑞·琼斯 Terry Jones 配音）所发明的能够将人类变成海星的药物，并被不知情的福来丢进了海中，为了拯救史黛拉，福来和恰克决定喝下另一种能够将人类变成鱼的药物，一同进入大海。 就这样，福来和恰克开始了他们在浩瀚海洋之中的奇妙旅程，两个男孩只有四十八个小时，时间一过，他们将永远保持鱼的形态，再也无法回到父母的身边。与此同时，一条名叫约翰（阿伦·瑞克曼 Alan Rickman 饰）亦喝下了神奇药物，拥有了和人类无二的智慧，它组建了一支军队，想要统治整个海洋王国。
决定历史命运的鸟羽伏见之战，在维新军的强大攻势下，幕府一方兵败如山倒，纵使心有不甘，云集了诸多高手的新选组也不得不在历史潮流的面前低头，吞下战败的苦果。在某个夜晚，雪村千鹤（桑岛法子 配音）目睹了土方岁三（三木真一郎 配音）被罗刹之血所折磨的痛苦一刻。另一方面，战胜者渐次逼近江户，新选组必须在此之前撤出江户，前往会津。风云突变的紧要关头，土方岁三不辞而别，冲田总司的健康状况已经到了崩溃边缘，而近藤勇（大川透 配音）也传出了即将问斩的消息。 曾经风光一时的新选组，在时代更迭的浪潮中迎来了黯然的落幕时刻……
秋津政之助（浪川大辅 配音）容易害羞的懦弱性格让他在生活上吃了不少的苦头，因此而丢失的工作更是不计其数。一日，刚刚被解雇的阿政遇见了一神秘男子。男子自称弥一（樱井孝宏 配音），想雇佣阿政担任个人保镖的职务，无所事事的阿政当即答应。没想到这次偶遇竟将阿政卷入了一宗绑架案件中去，而弥一正是江湖大名鼎鼎的犯罪团伙“五叶”的首领。会有怎样的遭遇等待着无辜的阿政呢？ 迫于生计，阿政成为了五叶的一份子。在五叶中，谜一样的弥一，美丽妖艳的阿竹（大浦冬华 配音），刀子嘴豆腐心的梅造（高冢正也 配音），沉默寡言的松吉（内田夕夜 配音），在和他们相处的过程中，阿政发现了这些身份扑朔迷离，个性亦正亦邪的浪人们不为人知的另一面。
由新海诚原作的短片原创动画《她和她的猫》，宣布改编成TV动画，剧中的“她”将由花泽香菜担任声优，而黑猫的声优将由浅沼晋太郎担任，矢作纱友里将为“她”的友人配音。本作的导演由坂本一也担任，剧本为永川成基，人设·总作画监督将由参与制作过《黑色子弹》的海岛千本担任，制作则交给了liDENFILMS京都工作室。
故事讲述了青梅竹马之间、学生会长与不良少女之间、前辈与后辈之间、同学之间等多种不同角色的恋爱群像剧。
故事以平凡小胖子乐乐的校园生活为背景，讲述钢铁飞龙——炽焰、深蓝、铁拳、Maggie、小星五位战士从未来世界穿越而来，在指导、带领乐乐在一次次击败怪兽的过程中，陪伴他成长为未来英雄的故事。全片除了有热血和冒险元素外，还会有小主角历险后的感悟，让孩子在英雄身上学会成长。
【bilibili出品】《有兽焉 第三季》最新PV上线！神兽们的故事还在继续！ 出品：bilibili 制作：@非人哉工作室
