《谍海追踪》作为当代反窃密、防泄密，展现我国国安人员为捍卫国家安全与境外间谍生死较量的电视剧，极其注重剧作的合理性与事件的逻辑性，故事情节跌宕起伏，矛盾冲突一触即发。同时该剧融入不少“烧脑”情节，黑客、间谍等独特亮点元素也在其中，是近年来谍战剧中难得的诚意之作
由上海怡然自得文化发展有限公司投资拍摄，郭德纲主演的《济公传》之活佛登基，2013年11月9日上午11点在横店影视城大智禅寺景区内的藏经阁举行了隆重的开机仪式。剧中主创和主演们在开机仪式后便投入到正式拍摄中。开机现场，郭德纲以一身潮版造型出场，其中一双大头皮鞋尤为抢镜。 在谈及自己首次出演电视剧版济公时郭德纲感到非常高兴，自己说了很多济公题材的相声后终于能开拍一部由自己主演的济公系列剧。该剧预期将在横店拍摄三个月左右，据郭德纲透露，除了老搭档于谦和孟非将在剧中出演外，圈中众多好友也将来友情客串。
黎明前的上海，社会各界知名人士纷纷响应中共民主主张，要求结束蒋家王朝专制统治。人心向背，大厦将倾，困兽犹斗的国民党国防部保密局，接受躲在溪口老家幕后指挥的蒋介石直接指令，针对那些无法公开清除的社会名人，炮制出一份“黑色名单”。 军统昆明站干将黄龙杰被抽调组建代号为“闪电”的特别行动小组，展开一系列瞒天过海的暗杀活动。为此，黄龙杰以药业公司代表身份，携带妻子和部下分批赶到上海，向上海站站长韩天石报到，同时展开行动。 上海地下党组织敏锐地发现了这一动向，决定成立“曙光”行动小组，由表面上八面玲珑的商界女强人、实为地下党员的中洋贸易公司单身女经理郭家月牵头，执行保护任务，以年画作坊为掩护的情报站主任王怀志担任这一小组的联络人。 “曙光”一出手即技惊四座，全歼黄龙杰直接从昆明带来的三员干将。由此也引起了黄龙杰的注意，而他毫无察觉的是，他和郭家月之间还存在着一个特殊的关联人物——黄龙杰的妻子沈惠芸正是郭家月的大学好友。 围绕保卫和清除，黄龙杰和郭家月斗智斗勇，他们的属下周海亮、杨帆、肖风、田雨等也各显身手，其间又发生了很多错综复杂的人物关系。
大明刑部狱卒叶小天接受委托，为人送遗书回故乡，遭到不想分割家产的那人家属追杀，逃入黔东。兵部要员艾枫以新任葫县典史前往黔东，调查权贵杨应龙图谋不轨之事，被杨应龙派人杀害。葫县县令花晴风为逃避治安不利的责任，安排叶小天冒充艾典史。叶小天虽是狱卒出身，一身浑不吝的痞劲儿，他并未甘为傀儡，在典史任上，他打击豪绅恶霸，把葫县搅了个天翻地覆，更因缘际会，成为真正的葫县典史，由此开始了他的仕途之路。升任铜仁府推官后，叶小天依旧独善其身，不与尸位素餐浑浑噩噩的无为官吏为伍，为了冤死的民女，他怒斩纨绔恶棍，由此身陷绝境，却也受到了地方百姓的爱戴和贵州爱国大土司的赞赏，最终成为一方土司官。始终坚信明照天下，虽土司治下亦是王土的叶小天联合贵州爱国大土司，遏制野心勃勃的杨应龙扩张，成为朝廷的一道坚实藩篱。
因“弘皙逆案”，京师四大家族赵、王、李、薛涉及其中。李家首被抄家籍没，赵頫父子谒见弘皙，请援李家。弘皙将李家罪产藏匿于府中，并觊觎四大家族的财产，为自己事业经济支持所用。赵家被卷入皇室矛盾，如惊弓之鸟。赵王氏为保赵家，棒打鸳鸯林颦儿(舒畅 饰)，骗赵芹(迟帅 饰)与薛家联姻....
受处分的刑警队长马东调到玉清市第一天上班，上班途中遭遇女警何雨晴在追拿犯罪嫌疑人，协助抓捕后接到电话说有案件，马东直接去了案件现场，马东与何雨晴随即介入案件。受害人叫王小蒙，是玉清学院的学生，现场侦查时候学校负责人试图推脱责任被马东一口叫破。受害人父亲接到通知，不能相信女儿去世的事实，恳请公安人员彻查此案，马东等人夜查学生宿舍，初步了解死者与同学间关系不太和睦，又了解到死者还有性爱视频流出传播，随即做了笔录结束当日的侦查工作。晚餐时刻，局长安排警局刑侦小队众人火锅店为新队长马东接风，席后马东送何雨晴回家，次日作为企业家的何雨晴母亲何苗在工地视察时候遇到有人刺杀自己。
