故事发生在古老和繁华并存的京都，矢泽信之（杉田智和 配音）所经营的居酒屋阿信坐落在此处，千佳忍（三森铃子 配音）是在店内工作的服务生，两人的搭档行事十分默契。让他们没有想到的是，不知从什么时候起，阿信的大门竟然连接上了异世界阿伊特力亚的入口，每一天，来这里小酌放松的异世界居民们络绎不绝。
　　对生啤有着狂热热爱的汉斯（阿部敦 配音）、个性十分爽朗略微有些不拘小节的尼古拉斯（森久保祥太郎 配音）、外表看上去非常凶恶严肃但实际上很温柔的贝特霍尔德（小西克幸 配音）、斤斤计较的税务官格诺特（津田健次郎 配音），他们聚集在阿信里，共同享受着难能可贵的放松时光。

　　柏木空（田村睦心 配音）是一名平凡的男子高中生，因为父亲是一位冒险家，常常不在家，因此，从很小的时候起柏木空就开始独立生活，变得非常擅长料理家事。这一天，柏木空收到了父亲从埃及寄来的包裹，打开包裹后，一个小小的木乃伊出现在了柏木空的面前，看着这个瑟瑟发抖的迷之生物，柏木空哭笑不得。
　　就这样，柏木空开始了和木乃伊一起的生活，肩负起了照顾小木乃伊的职责。之后，更多奇形怪状的生物出现在柏木空的身边——个性暴躁贪吃又懒惰的可尼、成熟稳重智商超群的阿勇。

　　永远的“6时59分”开始了——
　　在佑河家有着代代相传的止界术使用止界术，能够进入森罗万象尽数停止的“止界”。某天，主人公树里的外甥和哥哥，被诱拐犯绑架了。她为了救出他们而不得已使用了“止界术”，却遭到不应存在于那里的、除自己以外的“会动的”人类袭击。他们是尊崇止界术的“真纯实爱会”。围绕着使用止界术时所必需的“石头”，止界之谜、佑河家之谜逐渐浮出水面……

　　数千年后的未来，进入宇宙空间的人类，
　　被分为银河帝国与自由行星同盟这两个
　　拥有“专制政治”与“民主主义”两种不同政治体制的国家。
　　两国之间的抗争持续了150年，
　　以无边无际的广袤银河为舞台，
　　重复着无止境的战斗。
　　银河帝国的门阀贵族社会的腐败，
　　以及自由行星同盟可称为民主主义的弊端的群愚政治
　　侵蚀着两个国家。
　　之后，宇宙历8世纪末，两位天才的登场驱动了历史。
　　“常胜的天才”莱因哈特·冯·罗严克拉姆，
　　以及人称“不败的魔术师”的杨威利。
　　两人率领着帝国军与同盟军，展开了不知道是第几次的冲突。

　　璃星（佐仓绫音 配音）个性活泼开朗，对甜食有着超越了一般人的狂热。蓝璃（日高里菜 配音）容易沉浸在自己的世界里，外表沉默寡言的她是个容易害羞的女孩。情同手足的姐妹两人和哥哥（松冈祯丞 配音）生活在同一屋檐下，在哥哥的照料和保护之下，璃星和蓝璃的每一天都在快乐中度过。
　　超级吃货真子（高森奈津美 配音）、非常擅长料理家事但对烹饪却一窍不通的幸子（诹访彩花 配音）、口嫌体正直的女仆姬咲（徳井青空 配音）、经常容易感到肚子饿，沉默寡言内向害羞的流叶（大西沙织 配音），和兄妹三人一起生活的，还有这些个性迥异的女孩们。

　　主人公·翔子是就读于流星学园中等部的中学生。和她很亲密的姐姐·响子，自从5年前去海外留学后就失去了行踪。
　　某天，身份不明者突然袭击了翔子。
　　袭击了她的是过去被女神雅典娜所封印的邪神厄里斯的手下·邪精灵。
　　于是翔子得知了雅典娜以及圣斗士、圣斗少女的存在，同时也知道了自己和姐姐的残酷宿命。
　　灵魂被封印的邪神厄里斯即将复活，邪精灵们也变得活跃。
　　在星矢等人展开银河战争以及与十二宫的恶斗的另一面，沙织和圣斗少女借助黄金圣斗士的力量，展开了与邪精灵的壮烈战斗！
　　并且，恶之撒加也有了复活的征兆……。
　　将一切的钥匙掌握在手的，是为了成为圣斗少女而刚刚开始锻炼的翔子！
　　即使被残酷的命运击倒，少女们仍然反抗命运。
　　少女们与诸神的壮烈战斗物语开幕！

　　1274年，秋。
　　一艘流放船在暴风雨中驶向对马。目的地是流放地对马。御家人宗助国的女儿－辉日姬在对马迎接了流放船。
　　之后举行了接风宴，而在宴席上，流人们知道了一件可怕的事。从高丽出发的蒙古高丽大军，正向日本前来，而这些流人们，就将被送上战争的最前线，成为守护对马的军队人员。
　　“为了对马，请你们牺牲吧”辉日姬冷漠地对流人们说