本片是《麦兜故事》系列的第三部，由现实和动画两部分故事组成。
　　现实部分的故事开始于一次“人质挟持事件”，一群持枪匪徒闯入香港中环的国际金融中心（IFC），劫持了一家广告公司的数十名职员，在和警方对峙的关键时刻，匪徒提出要吃外卖盒饭，警方进一步调查发现此案线索涉及“春田花花幼儿园建校五十周年校庆”，而匪徒在与广告公司职员交谈时，发现某个直发披肩女孩（周笔畅）来自著名而神秘的网站春田花花幼儿园，产生好奇。而穿插在现实部分里的动画故事，春田花花幼儿园的小朋友幻想着自己将来快乐简单的理想职业生活，可是长大的他们（黄秋生、郑中基、梁咏琪等），换取温饱的方式多数变成了目标不分的随大流装傻。

　　故事发生在遥远的“猪猡纪”，那是一个由猪统治地球的年代。那时，小动物们对地球上各种资源开始了无节制地开采，导致整个地球乌烟瘴气，自然环境受到严重破坏。为了保护环境，扭转地球生态恶劣的局面，“猪猪侠”克服重重困难，终于研制出了一个具有神秘力量的“魔法智慧球”，自己却陷入到三千年才可轮回转世的魔咒当中，离开了人世。
　　他把“魔法智慧球”交付给了当时身份是厨师的王小二，并叮嘱他一定要完成拯救地球环境的使命。然而后来王小二背信弃义，利用“魔法智慧球”开创自己的王国，对地球环境的破坏更是变本加厉，人类生存苦不堪言。

　　故事发生在十八世纪的法国，此时的王朝正处于深受人民爱戴的路易十五国王的统治之下。在美丽的繁华大都市巴黎，鲜花和歌舞的背后，潜伏着无边无尽的罪恶和黑暗。这天，一位名为丽雅德（水野理纱 配音）的女子的灵柩飘过水面，牵扯出了一个牵扯到了整个欧洲的惊天秘密。
　　德恩（泰勇气 配音）是效力于路易十五的秘密警察，近日里接连发生的女子失踪事件让居民们陷入了恐慌，让德恩再也没有想到的是，自己的姐姐丽雅德，竟然也会成为凶徒的手下亡魂。作为案件的负责人，德恩展开了调查，然而随着时间的推移，德恩渐渐发现，这一切，并不是人们所想象的那么简单。

　　鲁路修本是帝国的王子，在母后遇害后，和失明的妹妹一起被流放到11区（原日本国）作为人质。在那里他们结识了日本王子朱雀，三人共同度过一段美好的童年时光。帝国最终全面攻陷了11区，鲁路修和妹妹的安宁生活再次被剥夺，朱雀和他们也分散了。
　　鲁路修和妹妹隐瞒身份，过着看似平凡的学生生活。然而鲁路修心中对于帝国的仇恨却未停止。他希望摧毁帝国，为妹妹营造一个可以快乐生活的世界。这一切随着神秘少女C.C的出现变得不再遥不可及。
　　此时朱雀也再次出现在他们的生活中，然而残酷的现实让童年的挚友难以重温童年往事。这里没有正义和邪恶，黑暗与光明，有的仅仅是艰难的抉择和难以预料的明天。

　　“我毕业于东中，叫做凉宫春日。我对普通的人类没有兴趣。你们之中要是有外星人、未来人、异世界人或者超能力者的话，就尽管来找我吧。”这是凉宫春日的宣言，也是她对于平庸生活的挑战。
　　我们可能在很小时就不再相信圣诞老人的存在，也慢慢不会再对外星人，特异功能等等产生幻想。在生活的教化下习惯于平淡无奇的生活。可是不安于现状的凉宫同学却勇敢的建立起SOS团，用强烈的意志去试图改造这个了无新意的世界。她的忧郁，究竟从何而来，又将从何而去。

　　故事发生在瑞穗坂学园，那是情人节的前一天，接到损友渡良濑准的一个电话，魔法科的天才少女神阪春姬将这一切都彻底地颠覆了，现在想起来者就是这一切的开端……魔法科校舍神秘倒塌，男主角和外表优雅实际上却比谁都爱哭得神阪春姬编进了同一个班级，本就吵闹的日子变得更加喧哗，而后他遇上了各种各样的同学们……对春姬有极强对抗意识的“移动灾害制造机”柊杏璃、“不可思议的姐姐”高峰小雪、行动慢于思考，分不清是正常还是发呆的小日向李子、还有美丽的女装渡良濑准，这样的校园生活会变得无比华丽浪漫吗？不知何去何从，未来指向何处？！

　　十冻京（浅沼晋太郎 配音）是一名活泼善良的高中生，担任着游泳部部长的职务，对生活和学习充满了热情。某日，十冻京偶然邂逅了名为三崎紫雫乃（川澄绫子 配音）的转校生，却没想到这场邂逅改变了十冻京的人生，亦改变了整个世界前进的轨道。
　　一场意外令十冻京被卷入了机器人之间的激烈战斗之中，温柔体贴的守凪了子（花泽香菜 配音）、学生会会长岛（坪井智浩 配音）和副会长港（井上麻里奈 配音）皆未能幸免，日常的校园生活被打破，非日常的危险与敌人接连来袭，在一场又一场九死一生的战斗之中，一个关于“现实世界”和“虚拟世界”的秘密渐渐露出了真正面目。

　　一天，大雄和静儿、技安被强夫邀到家中参观恐龙化石。当然，大雄免不了又被强夫取笑一番。为了要做强夫面前争一口气，大雄夸下海口，恐龙化石没什么了不起，他要让小伙伴们见识一下真正的恐龙！
　　奇迹再次发生在大雄身上，他真的找到了一颗活的恐龙蛋！大雄和叮当在家将小恐龙孵化了出来并在公园里暗中饲养。小恐龙比助一天天长大，公园有怪兽的消息传遍了日本。为了小恐龙能健康成长，大家决定将小恐龙用时光机送回白垩纪。
　　没料到，一个神秘人暗中跟踪他们，也来到了白垩纪想要虏走比助。为了保护比助，叮当、大雄、强夫、技安和静儿再次来到了白垩纪……

　　大发明家老夫子在赢得了一大批粉丝后，和助手大番薯继续着手他的发明事业，与医生秦先生、老爸王泽过着平淡的生活。怎料，一个突如而至的神秘包裹打乱了平静的生活——一个法力高强的魔界王掳走了王泽。由此，拉开了一个曲折的魔界历险旅程的序幕。为了救回王泽，维护童话故事的美好，老夫子、大番薯和秦医生一行穿越时空，经历了神灯传说、花木兰、十兄弟、新西游记……在历经千辛万苦、重重考验之后，老夫子三人不但救回了王泽，精采的故事更是吸引了更多的粉丝读者，《老夫子》的销量又上了一个新台阶，所有同事一同庆贺。岂料，在经历了刺激的历险旅程后，重归平淡生活的老夫子看着眼前千篇一律的庆祝活动，想着周而复始的日子，心又开始“不甘寂寞”，思索着渴望成为真人。一天，他一个人苦闷的溜到大街上游荡着。在不经意间走入了传说中通往现实生活的空白页，懵懵懂懂的闯入了香港的现实世界，展开了他的现实生活体验之旅……伴随着层出不穷的状况，笑料百出地体验了一把现实中的生活、工作和爱情，演绎出了又一部精彩的《新老夫子》传奇……

　　KERORO军曹寄住在日向家，竟因沉迷高达模型而惨变家务工人，更意外释放了一个来自“K隆星”远古时代的神秘武器KIRURU，令到全球大乱，面临毁灭危机！这时候，唯一知道如何拯救地球的谜样外星人突然现身，联同KERORO部队调转枪头、发动一场笑震宇宙的太空战争！

　　青春学园网球部称霸全国的目标又向前迈进了一步。代表中学网球最高水平的全国大赛开始了。之前饱受伤病困扰的部长手冢国光（置鲇龙太郎 配音）彻底愈合回归，而越前龙马（皆川纯子 配音）也从美国回到了日本，声称自己只是来加油的。青学迎战的第一场是来自冲绳的六角中学。六角中学故意伪造意外事故，让青学陷入了困境，为了能让青学获胜，大石（近藤孝行 配音）决定让龙马替自己征战。经过一番苦战，青春学园进入到了下一轮，而面对他们的是老对手——冰帝。这将是一番苦战！除此之外，之前在正片中出场的各大学校也将登场，进行最激烈的全国大赛。
　　本片改编自许斐刚的同名热门漫画全国大赛卷。

　　青春学园网球部称霸全国的目标又向前迈进了一步。代表中学网球最高水平的全国大赛开始了。之前饱受伤病困扰的部长手冢国光（置鲇龙太郎 配音）彻底愈合回归，而越前龙马（皆川纯子 配音）也从美国回到了日本，声称自己只是来加油的。青学迎战的第一场是来自冲绳的六角中学。六角中学故意伪造意外事故，让青学陷入了困境，为了能让青学获胜，大石（近藤孝行 配音）决定让龙马替自己征战。经过一番苦战，青春学园进入到了下一轮，而面对他们的是老对手——冰帝。这将是一番苦战！除此之外，之前在正片中出场的各大学校也将登场，进行最激烈的全国大赛。
　　本片改编自许斐刚的同名热门漫画全国大赛卷。

　　活泼的运动女孩日向咲，和喜爱美术的少女美翔舞，她们是就读夕凪中学的平凡中学生。为了阻止想用毁灭之力支配世界的邪恶大王，咲和舞借助泉之乡的精灵－弗拉比和乔比之力变身成传说中的战士“光之美少女”，努力对抗邪恶大王及其手下们的阴谋。

　　有一天，太阳的恩惠，也就是光变得微弱下来了，这可是大事件，这样下去，不可思议星将没有光，成为黑暗的世界！根据传说，为了让太阳的恩惠回到世界，需要只有太阳之国的公主才可以使用的魔法“prominence”。但是，能够拯救星球那样强力的prominence只有一名合格的公主才能够发动。

　　备长炭（野中蓝 配音）是一个身材娇小的蓝发少女，身着传统和服的她独自一人居住在林中的老屋之中。虽然独自生活有时会觉得孤独，但个性单纯开朗又勤劳的备长炭还是决定好好的珍惜每一天的时光。
　　好在孤独的日子不算太久，很快，备长炭的身边就聚集了一群同样可爱的朋友们，她还让出生在深宅大院的栎炭（野川樱 配音）明白了自己的命运应该由自己来掌控的道理。除此之外，胆小但聪明的竹炭（门胁舞 配音），其妹竹林（福圆美里 配音），天然呆桉树炭（中原麻衣 配音），无论哪方面看来都十分普通的芦荟（斋藤桃子 配音）还有傲娇可爱的莲炭（佐藤利奈 配音），她们都将备长炭看做自己不可缺少的朋友。在深林小屋中，备长炭快乐一天又开始了。

　　阳光明媚的一天，灰太狼和他老婆红太狼又一次向羊村发起攻击。不过这次灰太狼祭出了他的制胜法宝——可以把小羊瞬间烤熟的阴离子光球。一时间羊村大乱，灰太狼无往不利。关键时刻，喜羊羊拿来了村长的阳离子光球。结果两个光球发生激烈碰撞，导致时空严重扭曲，羊羊和灰太狼全部被卷入时空漩涡之中。当他们再次睁开眼，发现自己正置身一个鲜花盛开、和风送暖的美丽世界。羊羊们从蜜蜂皇后的口中得知，这里名叫古古怪界，一百年前曾有一个恶魔在此作乱，最终被蜜蜂的祖先封印在巨蛋之中。不凑巧的是，灰太狼夫妇无意中解开巨蛋的封印，恶魔黑大帅获得自由，并发誓毁灭光明道具，统治古古怪界。
　　为了阻止他的阴谋，羊羊们在自称先知的潇洒哥的帮助下，与黑大帅展开惊险刺激的对抗……

　　憨八龟居住在遥远的外太空星球变形星，在一场意外中，憨八龟和朋友们搭载着飞船逃往其他的星球，却在途中遭遇了空难，憨八龟一人流落到了地球上。热爱幻想的少年阿布、大大咧咧性格开朗的少女小美和智多星明仔发现了憨八龟，一行人很快就成为了好友。
　　受憨八龟所托，三个人类少年决定帮助它寻找失散的伙伴们。而铁甲小子、宝宝熊和百丈跳等外星来客们亦在找寻着憨八龟的踪迹。和它们一起来到地球的，还有贪婪而又邪恶的星际罪犯软骨虫，在它的挑拨离间之下，地球人对变形星人产生了误解，爆发了矛盾。憨八龟和伙伴们携手，最终能否破解软骨虫的阴谋？

　　大崎娜娜（朴璐美 配音），心怀音乐梦的朋克女青年，曾在家乡和男友本城莲（木内秀信 配音）、好友高木泰（川原庆久 配音）、寺岛伸夫（关智一 配音）合组乐队Black Stones，后因莲被当红乐队Trapnest挖角到东京发展，二人被迫分手。时隔两年，娜娜也决定前往东京， 找来泰和伸夫重整Black Stones旗鼓，誓要和莲的Trapnest一拼高下。小松奈奈（KAORI 配音），永远沉浸在恋爱梦中的不靠谱小镇姑娘，因男友远藤章司（高桥广树 配音）到东京求学备受异地恋煎熬，而今终于有机会移居东京陪伴章司。两个名字发音同为“nana”的女孩相遇在去往东京的新干线上，又十分凑巧地看重同一间“707”号公寓，二人决定合租。
　　两个性格迥然不同的女孩，加上两个竞争乐队的男孩们，从此生活、梦想、爱情、挫折就这样交织在一起，再也不可分……

　　上月由香（椎名碧流 配音）是一名职业跳伞师，她的工作是确保客人们在进行跳伞运动时的人身安全。表面上看，由香的外表清新个性甜美，但是在这样的外表下，却隐藏了一个惊天秘密。由香的体内隐藏着怪物的基因，每当情绪激动时，这基因便会使由香变异成外表可怖的食人鬼，而由香无法控制食人 鬼的所作所为，很多人成为了她手下的牺牲品。在工作中，由香结识了性格老实正直的桃田俊彦（木内秀信 配音），两人一见钟情。可是，俊彦也有着自己的秘密，他居然是一名专门猎杀食人鬼的怪物猎人，这样敌对的两个人，开始了漫长而痛苦的爱情历程。
　　桃田一马（吉野裕行 配音）是俊彦的同行，他有着先进的思想和强大的行动力，某一日，俊彦和一马的父亲被怪物杀死了，而所有的矛头都指向了由香。为了生存，也为了洗脱罪名，由香和俊彦踏上了逃亡的路途。

　　水银灯和真红两人从最初相遇到反目成仇的过程。共前、后两篇。

　　在一次对治某村庄食尸鬼的超自然事件时，平凡女警女警西洛斯·维多利亚遭到袭击，奄奄一息，关键时刻吸血鬼杀手阿尔卡特出现，铲除食尸鬼，并将西洛斯变成了吸血鬼的一员，她顺理成章也接触到了阿尔卡特背后的神秘组织，即为维护英国基督新教、与反基督怪物作战的皇家国教骑士团（Hellsing），在现任当家伊塔古拉·方布鲁克·维英格茨·赫尔辛的率领下，他们接手一桩桩危险且阴谋重重的任务。在这一过程中，与食尸鬼有关的事件层出不穷，死后背后有另一个神秘组织正在策划惊天阴谋。梵蒂冈特务局第十三课Iscariot机关局长安利哥•马克斯威尔、安德鲁森神父等重要人物相继现身，为了保护英国本土和基督新教，第九次十字军成立，而他们的对手则是纳粹余孽少校所率领的1000头食尸鬼组建的千禧年大军。
　　伦敦上空阴云密布，前所未有的正邪之战拉开序幕……

　　直人（森川智之 配音）和直也（石田彰 配音）是雾原家的两兄弟。由于拥有不同与常人的超能力，两人从很小的时候起就与养父御厨恭二郎（中村秀利 配音）与世隔绝居的住在荒无人烟的森林深处。也多亏了直人的陪伴，能够解读人心的直也才得以在这个充满黑暗和邪恶的世界中继续生活下去。
　　御厨恭二郎的死解开了森林里的结界，毫无社会经验的兄弟两人流落到人心叵测的社会中区。要在这里生存，就得吃饭，想吃饭，就要先赚钱。因为自身的超能力，两人几番经历的惊险时刻，亏有神秘的少女双海翔子（渡边明乃 配音）出手相助才得以脱险。而就在两人渐渐适应社会生活的时候，他们发现，自己貌似被卷入了某个阴谋之中。

　　公元2010年。全球规模的“超级飓风”使世界各国遭受了巨大的损失。已经膨胀到80亿的人口一下子减少了50亿，变成了30亿。经济和军事的均衡随之崩溃了。
　　北美、俄罗斯、北欧被冰雪覆盖，平原地区沉入大海，世界地图突变，混沌时代来临了。日本政府在各地建立经济特区，获得了一定的复兴。预先开发的“力量辅助”技术为复兴作出了巨大贡献。但是，特区以外的地区，贫困不断加剧，贫民区不断扩大。统治阶级自称为“Logos”，将“力量辅助”技术转而用于军事。他们将贫困阶级称为“Levinas(孤立者)”，排斥他们。
　　时光流逝，公元2035年。
　　脱离了为监视“Levinas”，镇压“Logos”内部的叛乱分子而组成的特殊部队“幻影”的主人公葛城丈与伙伴鹤泽，与神秘的少女登戸沙那巧遇。围绕着沙那，各种人的思虑纷繁缠绕，故事向前发展。他们3个人前进的方向上，究竟有什么......

　　在星奏学院里，学生被分为两类，一类是就读于普通科的平凡学生，另一类是就读于音乐科的能够看见音乐精灵的演奏天才。在一次偶然中，普通科的日野香穗子（高木礼子 配音）撞见了音乐精灵莉莉（水桥香织 配音）。莉莉赠予了完全不同音律的香穗子一把魔法小提琴，只要和小提琴心意相通，就算是完全没有经验的初学者也可以演奏出美妙的旋律。
　　凭借着魔法小提琴，香穗子被选中参加了学校的音乐演奏会。这突如其来的新人遭到了许多学生的妒忌和算计，但香穗子也因此结识了一帮热爱音乐的良师益友。冷酷毒舌的月森莲（谷山纪章 配音），沉默温柔的志水桂一（福山润 配音），开朗率真的土浦梁太郎（伊藤健太郎 配音），双重性格的柚木梓马（岸尾大辅 配音），在和这些天才们相处的过程中，香穗子发现，自己对于音乐的心意渐渐的发生了变化。